腸道菌叢與人體健康的深層關聯
疾病與腸道消化系統之間的關聯極為密切。人類的腸道菌叢由約 100 兆個細菌細胞 組成，橫跨超過 1,000 種細菌菌種，按菌種分類來看，人類腸道菌中主要的菌門(phylum)為厚壁菌門（Firmicutes）、擬桿菌門（Bacteroidetes）、放線菌門（Actinobacteria）、變形菌門（Proteobacteria）、梭桿菌門（Fusobacteria），其中厚壁菌門和擬桿菌門兩者所佔比例可達全部腸道菌的 90%以上
目前僅約 1% 的腸道細菌被成功培養，許多仍無法培養。在代謝性疾病的研究中顯示，不同疾病患者的腸道細菌構成存在顯著差異，顯示腸道微生物在疾病發展中扮演重要角色。
腸道菌叢的多樣性與健康的影響
科學研究顯示，腸道菌叢越豐富，罹患多種疾病的風險越低。飲食是影響腸道菌叢構成的最關鍵因素。當飲食趨於均衡時，腸道內的有益菌自然增長，幫助維持健康。
舉例來說，研究指出，當 瘦鼠食用肥鼠的糞便 後，體重增加，腸道菌株變為類似肥鼠的組成。另一個臨床試驗中，將瘦子的腸道菌株移植至代謝症候群患者，其 胰島素敏感度顯著改善，這一現象與腸道內丁酸生成細菌的增長有關。
短鏈脂肪酸與膳食纖維的作用
當食物進入結腸後，未被消化的膳食纖維經由腸道內的厭氧細菌進行酵解，釋放出短鏈脂肪酸，如乙酸、丙酸與丁酸。短鏈脂肪酸具有調節部分免疫細胞的功能，藉此調控發炎反應。
研究顯示，膳食纖維缺乏 將導致短鏈脂肪酸生成減少，影響腸道菌叢的平衡。依據台灣三次營養健康調查結果，台灣各年齡層的膳食纖維攝取量普遍低於衛福部建議的每日 25-35克 標準。
如何從日常生活中改善腸道健康？
- 運動：規律運動能促進腸道菌叢豐富度，增加短鏈脂肪酸的產生，有助於抗發炎與預防慢性疾病。
- 膳食纖維攝取：建議以未精緻的全穀類與根莖類食物為主，例如糙米、藜麥、紅藜等，並增加深色蔬菜、瓜果類、菇類與海藻類的攝取。
- 發酵食物：選擇含有益生菌的發酵食物，如味噌、泡菜、納豆、醋、紅麴、優酪乳、起司與優格，幫助維持腸道菌叢的平衡。
- 避免加工食品：加工食品中的 飽和脂肪酸 與添加物會擾亂腸道菌叢，應盡量選擇天然食材，減少高脂肪與高糖食品的攝取。
維持腸道菌的多樣性與豐富性是至關重要的，因為這樣就能穩定各菌叢之間的平衡。減少高糖，控制總脂肪的攝取量，增加omega3好油的飲食習慣、多攝取各式富含纖維的蔬菜、規律的作息與好的睡眠品質，這些皆有助於維持腸道菌的完整性。特別需要注意的是，抗生素的不當使用特別容易影響腸道菌，故減少不必要和不適當的抗生素使用是相當重要的。